MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pTrp

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002252	T	7	7	2199	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002252	TCC	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_002252	AAAACA	2	12	2283	2294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_002252	ACA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002252	T	6	6	2351	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002252	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002252	AAG	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002252	AGG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002252	A	6	6	2435	2440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002252	A	6	6	2449	2454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002252	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002252	GGTG	2	8	2491	2498	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002252	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002252	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002252	A	7	7	2689	2695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002252	TG	3	6	2791	2796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002252	AGAA	2	8	2814	2821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002252	GAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002252	CAT	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002252	TCT	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002252	AT	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002252	ACAA	2	8	3042	3049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002252	TGT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002252	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002252	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002252	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002252	CAAAA	2	10	3217	3226	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002252	T	6	6	3242	3247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002252	A	7	7	3250	3256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002252	T	10	10	3257	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002252	ATACA	2	10	3272	3281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002252	TA	5	10	3320	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002252	A	6	6	3365	3370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002252	ATTA	2	8	3392	3399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002252	A	7	7	3432	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002252	TAT	2	6	3449	3454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002252	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002252	ATTGTT	2	12	3469	3480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002252	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002252	ATTA	2	8	3496	3503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002252	TTTA	2	8	3511	3518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002252	TTA	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002252	AT	4	8	3540	3547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002252	T	6	6	3554	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002252	ATT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002252	TTTAA	2	10	3585	3594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002252	AGTT	2	8	3597	3604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002252	T	7	7	3630	3636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002252	A	7	7	3663	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002252	ACA	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002252	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002252	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002252	CAG	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002252	TAA	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002252	A	8	8	3761	3768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002252	CTG	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002252	CT	3	6	3845	3850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002252	A	7	7	3896	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002252	T	6	6	3908	3913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002252	A	7	7	3915	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002252	ACA	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002252	TGA	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002252	A	7	7	3974	3980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002252	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002252	AAC	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002252	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002252	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002252	TTTA	2	8	4152	4159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002252	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002252	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002252	A	9	9	4188	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002252	A	7	7	4239	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002252	A	7	7	4253	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002252	AGA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002252	AGAAA	2	10	4273	4282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002252	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002252	A	7	7	4378	4384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002252	AATT	2	8	4392	4399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002252	T	8	8	4439	4446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002252	A	8	8	4483	4490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002252	T	6	6	4511	4516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002252	ATG	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002252	A	7	7	4578	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002252	A	7	7	4633	4639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002252	CAG	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002252	AGT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002252	AATT	2	8	4938	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002252	GAAGGG	2	12	4955	4966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002252	CGG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002252	CAA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002252	GTT	2	6	5087	5092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002252	AG	3	6	5124	5129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002252	TAA	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002252	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002252	T	7	7	5830	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002252	TCC	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_002252	AAAACA	2	12	5914	5925	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_002252	ACA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002252	T	6	6	5982	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002252	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002252	AAG	2	6	6015	6020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002252	AGG	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002252	A	6	6	6066	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002252	A	6	6	6080	6085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002252	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002252	GGTG	2	8	6122	6129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002252	CAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002252	T	6	6	6287	6292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002252	A	7	7	6320	6326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002252	G	6	6	6327	6332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002252	TG	3	6	6421	6426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002252	AGAA	2	8	6444	6451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002252	GAG	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002252	CAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002252	TCT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002252	AT	3	6	6591	6596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002252	ACAA	2	8	6672	6679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002252	TGT	2	6	6725	6730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002252	A	7	7	6760	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002252	T	7	7	6773	6779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002252	A	6	6	6820	6825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002252	CAAAA	2	10	6848	6857	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_002252	T	6	6	6873	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002252	A	7	7	6881	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002252	T	9	9	6888	6896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002252	ATACA	2	10	6902	6911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002252	TA	5	10	6950	6959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002252	A	6	6	6995	7000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002252	ATTA	2	8	7022	7029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002252	A	7	7	7062	7068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002252	TAT	2	6	7079	7084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002252	AT	3	6	7083	7088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002252	ATTGTT	2	12	7099	7110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002252	TAT	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002252	ATTA	2	8	7126	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002252	TTTA	2	8	7141	7148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002252	TTA	2	6	7155	7160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002252	AT	4	8	7170	7177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002252	T	6	6	7184	7189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002252	ATT	2	6	7207	7212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002252	TTTAA	2	10	7215	7224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002252	AGTT	2	8	7227	7234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.